Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSF2P04141 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms