Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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