Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCATO75600 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCATO75600 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms