Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNC1O60486 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms