Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms