Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT7O43581 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT7O43581 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT7O43581 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT7O43581 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT7O43581 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT7O43581 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT7O43581 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT7O43581 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT7O43581 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYT7O43581 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYT7O43581 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYT7O43581 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYT7O43581 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYT7O43581 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYT7O43581 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYT7O43581 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms