Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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