Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMINO43313 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 TMEM92-AS1-201ENST00000508851 750 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMINO43313 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMINO43313 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms