Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.2 ms