Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBDO15205 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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