Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms