Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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