Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms