Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms