Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms