Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GJA3Q9Y6H8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA3Q9Y6H8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA3Q9Y6H8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms