Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms