Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTNQ9Y639 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms