Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRBQ9Y5M8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRBQ9Y5M8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms