Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB12Q9Y5F1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms