Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRRAPQ9Y4A5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRRAPQ9Y4A5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms