Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms