Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO2Q9Y3B8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO2Q9Y3B8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO2Q9Y3B8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO2Q9Y3B8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO2Q9Y3B8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO2Q9Y3B8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO2Q9Y3B8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO2Q9Y3B8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO2Q9Y3B8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
REXO2Q9Y3B8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
REXO2Q9Y3B8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms