Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMED7Q9Y3B3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms