Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED5Q9Y3A6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216 ms