Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG3Q9Y2Y8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms