Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHDC2Q9Y2U9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHDC2Q9Y2U9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC2Q9Y2U9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms