Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSX2IPQ9Y2D8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms