Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP3Q9Y228 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP3Q9Y228 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms