Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNND2Q9UQB3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms