Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SATB2Q9UPW6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms