Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP22Q9UPT9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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