Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG5Q9UPR3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms