Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRQQ9UMZ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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