Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FZD4Q9ULV1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FZD4Q9ULV1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FZD4Q9ULV1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms