Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SARDHQ9UL12 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms