Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AMFRQ9UKV5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms