Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP3Q9UKI2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP3Q9UKI2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP3Q9UKI2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP3Q9UKI2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP3Q9UKI2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP3Q9UKI2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDC42EP3Q9UKI2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms