Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM8Q9UJA3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM8Q9UJA3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms