Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF11Q9UIL8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF11Q9UIL8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms