Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFF4Q9UHB7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms