Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO40Q9UH90 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms