Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CNOT8Q9UFF9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms