Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM8A1Q9UBU6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM8A1Q9UBU6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms