Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
POLKQ9UBT6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
POLKQ9UBT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms