Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPR1Q9UBH6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPR1Q9UBH6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms