Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH4Q9P2E8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms