Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABI3Q9P2A4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABI3Q9P2A4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms