Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRD1Q9P1U0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRD1Q9P1U0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRD1Q9P1U0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRD1Q9P1U0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRD1Q9P1U0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRD1Q9P1U0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRD1Q9P1U0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRD1Q9P1U0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRD1Q9P1U0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRD1Q9P1U0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms