Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXXC1Q9P0U4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms